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Mikrobielle Biogeochemie

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Die terrestrische Mikrobiota in Aktion.
Die Arbeitsgruppe erforscht die Bedeutung der Mikrobiota für (i) das Klima, (ii) den Kohlenstoffvorrat im Boden und (iii) die Resilienz von Pflanzen. Sie erforscht dafür die Mikrobiota in Landschaftselementen von Agrarlandschaften. Der Schwerpunkt der Forschung liegt dabei auf Acker- und Grünländern. Ausgewählte Getreide- und Baumarten dienen als Modellpflanzen. Die Gruppe nutzt Genmarker, Metagenomik, stabile Isotopenbeprobung und RNA-basierte Methoden einschließlich Bioinformatik, um Funktionen und Dynamik der Pflanzen- und Bodenmikrobiota zu bestimmen. Sie nutzt die Messungen von Bodenenzymen und Gasanalytik, um den mikrobiellen Stoffwechsel und die Emissionen von Treibhausgasen und VOCs zu charakterisieren. Experimentelle Untersuchungen werden sowohl auf der Skala der Einzelpflanze (Topfexperimente) als auch auf der Ebene von Ökosystemen (Feld- & Landschaft) durchgeführt. Darüber hinaus ist die Ökophysiologie von Methylotrophen und Nitratreduzierern (inkl. anaerober Kultivierung & Genomik) ein Untersuchungsgegenstand.

 

 

 Publikationen AG

MyTitle: Pseudomonas campi sp. nov., a nitrate-reducing bacterium isolated from grassland soil
MyLinkAnsehenUrl: https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004799, Ansehen
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MyAutoren: Timsy, T., Spanner, T., Ulrich, A., Kublik, S., Foesel, B. U., Kolb, S., Horn, M. A., Behrendt, U. (2021)
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Pseudomonas campi sp. nov., a nitrate-reducing bacterium isolated from grassland soil

Timsy, T., Spanner, T., Ulrich, A., Kublik, S., Foesel, B. U., Kolb, S., Horn, M. A., Behrendt, U. (2021)
MyTitle: Biochar mitigates effects of pesticides on soil biological activities
MyLinkAnsehenUrl: https://doi.org/10.1007/s42398-021-00190-w, Ansehen
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MyAutoren: Egamberdieva, D., Jabbarov, Z., Arora, N. K., Wirth, S., Bellingrath-Kimura, S. D. (2021)
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Biochar mitigates effects of pesticides on soil biological activities

Egamberdieva, D., Jabbarov, Z., Arora, N. K., Wirth, S., Bellingrath-Kimura, S. D. (2021)
MyTitle: 13C-chloromethane incubations provide evidence for novel bacterial chloromethane degraders in a living tree fern
MyLinkAnsehenUrl: https://doi.org/10.1111/1462-2920.15638, Ansehen
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MyAutoren: Kröber, E., Wende, S., Kanukollu, S., Buchen, C., Besaury, L., Keppler, F., Vuilleumier, S., Kolb, S., Bringel, F. (2021)
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13C-chloromethane incubations provide evidence for novel bacterial chloromethane degraders in a living tree fern

Kröber, E., Wende, S., Kanukollu, S., Buchen, C., Besaury, L., Keppler, F., Vuilleumier, S., Kolb, S., Bringel, F. (2021)
MyTitle: Spatially-distributed microbial enzyme activities at intact, coated macropore surfaces in Luvisol Bt-horizons
MyLinkAnsehenUrl: https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2021.108193, Ansehen
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MyAutoren: Leue, M., Holz, M., Gerke, H. H., Taube, R., Puppe, D., Wirth, S. (2021)
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Spatially-distributed microbial enzyme activities at intact, coated macropore surfaces in Luvisol Bt-horizons

Leue, M., Holz, M., Gerke, H. H., Taube, R., Puppe, D., Wirth, S. (2021)
MyTitle: Metabarcoding for the Characterization of Terrestrial Microbiota - Pitfalls and Solutions. Microorganisms
MyLinkAnsehenUrl: https://doi.org/10.3390/microorganisms9020361, Ansehen
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MyAutoren: Francioli, D., Lentendu, G., Lewin, S., Kolb, S. DNA (2021)
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Metabarcoding for the Characterization of Terrestrial Microbiota - Pitfalls and Solutions. Microorganisms

Francioli, D., Lentendu, G., Lewin, S., Kolb, S. DNA (2021)
MyTitle: Divergent drivers of the microbial methane sink in temperate forest and grassland soils
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MyLinkPDFUrl: https://www.zalf.de/de/aktuelles/Dokumente%20PublikationenProjekte/PB1/GBC%20Taeumer_Kolb2020.pdf, PDF ansehen
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MyAutoren: Jana Täumer, Steffen Kolb, Runa S. Boeddinghaus, Haitao Wang, Ingo Schöning, Marion Schrumpf, Tim Urich, Sven Marhan (2021)
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Divergent drivers of the microbial methane sink in temperate forest and grassland soils

Jana Täumer, Steffen Kolb, Runa S. Boeddinghaus, Haitao Wang, Ingo Schöning, Marion Schrumpf, Tim Urich, Sven Marhan (2021)

 Projekte AG

MyTitle: Dynamiken von Methanflüssen in Söllen einer postglazialen Landschaft -mikrobielle Ökologie und Biogeochemie (MeDKet)
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MyTextfeld: Laufzeit: 01.10.2021 - 30.09.2024
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Dynamiken von Methanflüssen in Söllen einer postglazialen Landschaft -mikrobielle Ökologie und Biogeochemie (MeDKet)

Laufzeit: 01.10.2021 - 30.09.2024
MyTitle: Drivers of the Nitrogen-Cycling Core Microbiota of Wheat (NMicro)
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MyTextfeld: Laufzeit: Mai 2019 – April 2022
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Drivers of the Nitrogen-Cycling Core Microbiota of Wheat (NMicro)

Laufzeit: Mai 2019 – April 2022
MyTitle: Wissenschaftler*innen Austausch - Chinesisch-Deutsches Zentrum (2021-2023): From Microbe to Satellite: Synthesis of the Methane Budget in the Context of Agri-Ecological Sustainability
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Wissenschaftler*innen Austausch - Chinesisch-Deutsches Zentrum (2021-2023): From Microbe to Satellite: Synthesis of the Methane Budget in the Context of Agri-Ecological Sustainability

MyTitle: Erhalt der Gemeinen Esche (FraxForFuture); Verbundvorhaben 4: Phytopathologie; Teilvorhaben 9: Optimierung der Mikrobiota vitaler Eschen-Genotypen zur Erhöhung der Widerstandsfähigkeit gegenüber H. fraxineus (Frax-ProMic2)
MyLinkAnsehenUrl: https://www.zalf.de/de/forschung_lehre/projekte/Seiten/details.aspx?iddp=2164, Ansehen
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MyTextfeld: Start: 01.07.2020
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Erhalt der Gemeinen Esche (FraxForFuture); Verbundvorhaben 4: Phytopathologie; Teilvorhaben 9: Optimierung der Mikrobiota vitaler Eschen-Genotypen zur Erhöhung der Widerstandsfähigkeit gegenüber H. fraxineus (Frax-ProMic2)

Start: 01.07.2020
MyTitle: Der Einfluss von Erosion auf die Kohlenstoff-Dynamik in einem Kontinuum aus Getreidepflanze, Rhizosphären-Mikrobiom und organischer Bodensubstanz (CropRhizoSOM)
MyLinkAnsehenUrl: https://www.zalf.de/de/forschung_lehre/projekte/Seiten/details.aspx?iddp=2146, Ansehen
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MyTextfeld: Start: 01.02.2020
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Der Einfluss von Erosion auf die Kohlenstoff-Dynamik in einem Kontinuum aus Getreidepflanze, Rhizosphären-Mikrobiom und organischer Bodensubstanz (CropRhizoSOM)

Start: 01.02.2020
MyTitle: VolCorn - Volatilom eines Getreide Mikroben Systems unter Trockenheit und Überflutung
MyLinkAnsehenUrl: https://www.zalf.de/de/forschung_lehre/projekte/Seiten/details.aspx?iddp=2102, Ansehen
MyLinkPDFUrl: https://comm.zalf.de/sites/volcorn, VolCorn Webseite
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MyTextfeld: Laufzeit: 01.01.2019 - 31.12.2022
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VolCorn - Volatilom eines Getreide Mikroben Systems unter Trockenheit und Überflutung

Laufzeit: 01.01.2019 - 31.12.2022

 

Kontakt

 

Leitung der Arbeitsgruppe

Prof. Dr. Steffen Kolb
T +49 (0)33432 82-326

 

Adresse

Leibniz-Zentrum für
Agrarlandschaftsforschung (ZALF) e. V.

Eberswalder Straße 84
15374 Müncheberg​

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