Neben der Gesamtleitung des ZALF obliegt dem Direktorat die Hauptverantwortung für die stetige Weiterentwicklung des integrativen Forschungsprogramms durch Diskussionen in verschiedenen Gremien und Arbeitsgruppen. Das Direktorat unterstützt die Vernetzung der Forschungsarbeiten des ZALF mit nationalen und internationalen Forschungsverbünden und koordiniert europäische Forschungsprojekte.

Die Forschungstätigkeit verläuft thematisch quer zu den Instituten und konzentriert sich auf Strategien zur Nachhaltigkeitsbewertung von Landnutzungsfunktionen sowie auf Wissenskondensation an der Schnittstelle zwischen Wissenschaft und Politik und auf den Wissens- und Technologietransfer.

Daraus lassen sich folgende Aufgabenfelder ableiten: